Sepuluh tahun kemudian, Marie Thomas mendapatkan gelar doktornya, suatu pencapaian yang berdampak internasional sehingga bahkan sebuah surat kabar Belanda pun mengumumkan kelulusannya.
Setelah lulus, dia langsung bekerja di salah satu rumah sakit terbesar di Batavia (sebutan untuk Jakarta saat ini).
Marie Thomas kemudian pindah ke Padang, di mana dia melanjutkan karirernya yang luar biasa sebagai salah satu dokter pertama yang memperkenalkan metode kontrasepsi kepada wanita di seluruh nusantara.
Terkenal karena kemurahan hatinya, Marie Thomas sering memberikan perawatan gratis kepada mereka yang tidak mampu membayar.