Sinopsis Military Prosecutor Doberman mengisahkan Do Bae Man (diperankan oleh Ahn Bo Hyun) yang merupakan seorang jaksa militer. Tujuan hidupnya adalah memperoleh kesuksesan dan kekayaan.
Tujuan hidupnya menjadi jaksa sebenarnya adalah untuk balas dendam.
Sebagai jaksa pemula, kemampuan analisisnya tidak perlu diragukan lagi.
Cha Woo In bertemu dengan Do Bae Man (diperankan oleh Jo Bo Ah) karena memiliki tugas yang sama. Mereka harus bekerjasama menghancurkan kejahatan tersembunyi di militer.